partial fix for physically deleted records, but logic could benefit from a
[Biblio-Isis] / IsisDB.pm
index 87709db..df6dc0d 100644 (file)
--- a/IsisDB.pm
+++ b/IsisDB.pm
@@ -2,12 +2,14 @@ package IsisDB;
 use strict;
 
 use Carp;
+use File::Glob qw(:globally :nocase);
+
 use Data::Dumper;
 
 BEGIN {
        use Exporter ();
        use vars qw ($VERSION @ISA @EXPORT @EXPORT_OK %EXPORT_TAGS);
-       $VERSION     = 0.05;
+       $VERSION     = 0.08;
        @ISA         = qw (Exporter);
        #Give a hoot don't pollute, do not export more than needed by default
        @EXPORT      = qw ();
@@ -96,7 +98,8 @@ Options are described below:
 =item isisdb
 
 This is full or relative path to ISIS database files which include
-common prefix of C<.FDT>, C<.MST>, C<.CNT>, C<.XRF> and C<.MST> files.
+common prefix of C<.MST>, and C<.XRF> and optionally C<.FDT> (if using
+C<read_fdt> option) files.
 
 In this example it uses C<./cds/cds.MST> and related files.
 
@@ -134,13 +137,29 @@ sub new {
                $self->{$v} = {@_}->{$v};
        }
 
+       my @isis_files = grep(/\.(FDT|MST|XRF|CNT)$/i,glob($self->{isisdb}."*"));
+
+       foreach my $f (@isis_files) {
+               my $ext = $1 if ($f =~ m/\.(\w\w\w)$/);
+               $self->{lc($ext)."_file"} = $f;
+       }
+
+       my @must_exist = qw(mst xrf);
+       push @must_exist, "fdt" if ($self->{read_fdt});
+
+       foreach my $ext (@must_exist) {
+               croak "missing ",uc($ext)," file in ",$self->{isisdb} unless ($self->{$ext."_file"});
+       }
+
+       print STDERR "## using files: ",join(" ",@isis_files),"\n" if ($self->{debug});
+
        # if you want to read .FDT file use read_fdt argument when creating class!
-       if ({@_}->{read_fdt} && -e $self->{isisdb}.".FDT") {
+       if ($self->{read_fdt} && -e $self->{fdt_file}) {
 
                # read the $db.FDT file for tags
                my $fieldzone=0;
 
-               open(fileFDT, $self->{isisdb}.".FDT") || croak "can't read '$self->{isisdb}.FDT': $!";
+               open(fileFDT, $self->{fdt_file}) || croak "can't read '$self->{fdt_file}': $!";
 
                while (<fileFDT>) {
                        chomp;
@@ -164,7 +183,7 @@ sub new {
 
        # Get the Maximum MFN from $db.MST
 
-       open(fileMST,$self->{isisdb}.".MST") || croak "can't read '$self->{isisdb}.MST': $!";
+       open($self->{'fileMST'}, $self->{mst_file}) || croak "can't open '$self->{mst_file}': $!";
 
        # MST format:   (* = 32 bit signed)
        # CTLMFN*       always 0
@@ -172,21 +191,44 @@ sub new {
        # NXTMFB*       last block allocated to master file
        # NXTMFP        offset to next available position in last block
        # MFTYPE        always 0 for user db file (1 for system)
-       seek(fileMST,4,0);
+       seek($self->{'fileMST'},4,0);
 
        my $buff;
 
-       read(fileMST, $buff, 4);
+       read($self->{'fileMST'}, $buff, 4);
        $self->{'NXTMFN'}=unpack("l",$buff) || carp "NXTNFN is zero";
 
        # save maximum MFN
        $self->{'maxmfn'} = $self->{'NXTMFN'} - 1;
 
-       close(fileMST);
+
+
+
+       print STDERR Dumper($self),"\n" if ($self->{debug});
+
+       # open files for later
+       open($self->{'fileXRF'}, $self->{xrf_file}) || croak "can't open '$self->{xrf_file}': $!";
+
+       $self ? return $self : return undef;
+}
+
+=head2 read_cnt
+
+This function is not really used by module, but can be useful to find info
+about your index (if debugging it for example).
+
+  print Dumper($isis->read_cnt);
+
+=cut
+
+sub read_cnt  {
+       my $self = shift;
+
+       croak "missing CNT file in ",$self->{isisdb} unless ($self->{cnt_file});
 
        # Get the index information from $db.CNT
    
-       open(fileCNT, $self->{isisdb}.".CNT") || croak "can't read '$self->{isisdb}.CNT': $!";
+       open(fileCNT, $self->{cnt_file}) || croak "can't read '$self->{cnt_file}': $!";
 
        # There is two 26 Bytes fixed lenght records
 
@@ -210,31 +252,25 @@ sub new {
                my $buff = shift || return;
                my @arr = unpack("ssssssllls", $buff);
 
-               print "unpack_cnt: ",join(" ",@arr),"\n" if ($self->{'debug'});
+               print STDERR "unpack_cnt: ",join(" ",@arr),"\n" if ($self->{'debug'});
 
                my $IDTYPE = shift @arr;
                foreach (@flds) {
-                       $self->{$IDTYPE}->{$_} = abs(shift @arr);
+                       $self->{cnt}->{$IDTYPE}->{$_} = abs(shift @arr);
                }
        }
 
+       my $buff;
+
        read(fileCNT, $buff, 26);
        $self->unpack_cnt($buff);
 
        read(fileCNT, $buff, 26);
        $self->unpack_cnt($buff);
 
-
        close(fileCNT);
 
-       print Dumper($self),"\n" if ($self->{debug});
-
-       # open files for later
-       open($self->{'fileXRF'}, $self->{isisdb}.".XRF") || croak "can't open '$self->{isisdb}.XRF': $!";
-
-       open($self->{'fileMST'}, $self->{isisdb}.".MST") || croak "can't open '$self->{isisdb}.MST': $!";
-
-       $self ? return $self : return undef;
+       return $self->{cnt};
 }
 
 =head2 fetch
@@ -258,71 +294,76 @@ sub fetch {
 
        my $mfn = shift || croak "fetch needs MFN as argument!";
 
-       print "fetch: $mfn\n" if ($self->{debug});
+       # is mfn allready in memory?
+       my $old_mfn = $self->{'current_mfn'} || -1;
+       return $self->{record} if ($mfn == $old_mfn);
+
+       print STDERR "## fetch: $mfn\n" if ($self->{debug});
 
        # XXX check this?
        my $mfnpos=($mfn+int(($mfn-1)/127))*4;
 
-       print "seeking to $mfnpos in file '$self->{isisdb}.XRF'\n" if ($self->{debug});
+       print STDERR "## seeking to $mfnpos in file '$self->{xrf_file}'\n" if ($self->{debug});
        seek($self->{'fileXRF'},$mfnpos,0);
 
        my $buff;
 
+       # delete old record
+       delete $self->{record};
+
        # read XRFMFB abd XRFMFP
        read($self->{'fileXRF'}, $buff, 4);
        my $pointer=unpack("l",$buff) || carp "pointer is null";
 
+       # check for logically deleted record
+       if ($pointer < 0) {
+               print STDERR "## record $mfn is logically deleted\n" if ($self->{debug});
+               $self->{deleted} = $mfn;
+
+               return unless $self->{include_deleted};
+
+               $pointer = abs($pointer);
+       }
+
        my $XRFMFB = int($pointer/2048);
        my $XRFMFP = $pointer - ($XRFMFB*2048);
 
-       print "XRFMFB: $XRFMFB XRFMFP: $XRFMFP\n" if ($self->{debug});
+       # (XRFMFB - 1) * 512 + XRFMFP
+       # why do i have to do XRFMFP % 1024 ?
 
-       # XXX fix this to be more readable!!
-       # e.g. (XRFMFB - 1) * 512 + XRFMFP
+       my $blk_off = (($XRFMFB - 1) * 512) + ($XRFMFP % 512);
 
-       my $offset = $pointer;
-       my $offset2=int($offset/2048)-1;
-       my $offset22=int($offset/4096);
-       my $offset3=$offset-($offset22*4096);
-       if ($offset3>512) {
-               $offset3=$offset3-2048;
-       }
-       my $offset4=($offset2*512)+$offset3;
-
-       print "$offset - $offset2 - $offset3 - $offset4\n" if ($self->{debug});
+       print STDERR "## pointer: $pointer XRFMFB: $XRFMFB XRFMFP: $XRFMFP offset: $blk_off\n" if ($self->{'debug'});
 
        # Get Record Information
 
-       seek($self->{'fileMST'},$offset4,0);
+       seek($self->{'fileMST'},$blk_off,0);
 
        read($self->{'fileMST'}, $buff, 4);
        my $value=unpack("l",$buff);
 
+       print STDERR "## offset for rowid $value is $blk_off (blk $XRFMFB off $XRFMFP)\n" if ($self->{debug});
+
        if ($value!=$mfn) {
-print ("Error: The MFN:".$mfn." is not found in MST(".$value.")");    
-               return -1;      # XXX deleted record?
-       }
+               if ($value == 0) {
+                       print STDERR "## record $mfn is physically deleted\n" if ($self->{debug});
+                       $self->{deleted} = $mfn;
+                       return;
+               }
 
-#      $MFRL=$self->Read16($fileMST);
-#      $MFBWB=$self->Read32($fileMST);
-#      $MFBWP=$self->Read16($fileMST);
-#      $BASE=$self->Read16($fileMST);
-#      $NVF=$self->Read16($fileMST);
-#      $STATUS=$self->Read16($fileMST);
+               carp "Error: MFN ".$mfn." not found in MST file, found $value";    
+               return;
+       }
 
        read($self->{'fileMST'}, $buff, 14);
 
        my ($MFRL,$MFBWB,$MFBWP,$BASE,$NVF,$STATUS) = unpack("slssss", $buff);
 
-       print "MFRL: $MFRL MFBWB: $MFBWB MFBWP: $MFBWP BASE: $BASE NVF: $NVF STATUS: $STATUS\n" if ($self->{debug});
+       print STDERR "## MFRL: $MFRL MFBWB: $MFBWB MFBWP: $MFBWP BASE: $BASE NVF: $NVF STATUS: $STATUS\n" if ($self->{debug});
 
-       # delete old record
-       delete $self->{record};
+       warn "MFRL $MFRL is not even number" unless ($MFRL % 2 == 0);
 
-       if (! $self->{'include_deleted'} && $MFRL < 0) {
-               print "## logically deleted record $mfn, skipping...\n" if ($self->{debug});
-               return;
-       }
+       warn "BASE is not 18+6*NVF" unless ($BASE == 18 + 6 * $NVF);
 
        # Get Directory Format
 
@@ -332,17 +373,13 @@ print ("Error: The MFN:".$mfn." is not found in MST(".$value.")");
 
        read($self->{'fileMST'}, $buff, 6 * $NVF);
 
-       my $fld_len = 0;
+       my $rec_len = 0;
 
        for (my $i = 0 ; $i < $NVF ; $i++) {
 
-#              $TAG=$self->Read16($fileMST);
-#              $POS=$self->Read16($fileMST);
-#              $LEN=$self->Read16($fileMST);
-
                my ($TAG,$POS,$LEN) = unpack("sss", substr($buff,$i * 6, 6));
 
-               print "TAG: $TAG POS: $POS LEN: $LEN\n" if ($self->{debug});
+               print STDERR "## TAG: $TAG POS: $POS LEN: $LEN\n" if ($self->{debug});
 
                # The TAG does not exists in .FDT so we set it to 0.
                #
@@ -358,12 +395,14 @@ print ("Error: The MFN:".$mfn." is not found in MST(".$value.")");
                push @FieldPOS,$POS;
                push @FieldLEN,$LEN;
 
-               $fld_len += $LEN;
+               $rec_len += $LEN;
        }
 
        # Get Variable Fields
 
-       read($self->{'fileMST'},$buff,$fld_len);
+       read($self->{'fileMST'},$buff,$rec_len);
+
+       print STDERR "## rec_len: $rec_len poc: ",tell($self->{'fileMST'})."\n" if ($self->{debug});
 
        for (my $i = 0 ; $i < $NVF ; $i++) {
                # skip zero-sized fields
@@ -371,9 +410,10 @@ print ("Error: The MFN:".$mfn." is not found in MST(".$value.")");
 
                push @{$self->{record}->{$FieldTAG[$i]}}, substr($buff,$FieldPOS[$i],$FieldLEN[$i]);
        }
-       close(fileMST);
 
-       print Dumper($self),"\n" if ($self->{debug});
+       $self->{'current_mfn'} = $mfn;
+
+       print STDERR Dumper($self),"\n" if ($self->{debug});
 
        return $self->{'record'};
 }
@@ -467,7 +507,7 @@ sub to_hash {
        my $mfn = shift || confess "need mfn!";
 
        # init record to include MFN as field 000
-       my $rec = { '000' => $mfn };
+       my $rec = { '000' => [ $mfn ] };
 
        my $row = $self->fetch($mfn);
 
@@ -480,7 +520,7 @@ sub to_hash {
                        my $val;
 
                        # has identifiers?
-                       ($val->{'i1'},$val->{'i2'}) = ($1,$2) if ($l =~ s/^([01 #])([01 #])//);
+                       ($val->{'i1'},$val->{'i2'}) = ($1,$2) if ($l =~ s/^([01 #])([01 #])\^/\^/);
 
                        # has subfields?
                        if ($l =~ m/\^/) {