transfer all input variables to open_db in input module
[webpac2] / lib / WebPAC / Input.pm
1 package WebPAC::Input;
2
3 use warnings;
4 use strict;
5
6 use blib;
7
8 use WebPAC::Common;
9 use base qw/WebPAC::Common/;
10 use Text::Iconv;
11 use Data::Dumper;
12
13 =head1 NAME
14
15 WebPAC::Input - read different file formats into WebPAC
16
17 =head1 VERSION
18
19 Version 0.05
20
21 =cut
22
23 our $VERSION = '0.05';
24
25 =head1 SYNOPSIS
26
27 This module implements input as database which have fixed and known
28 I<size> while indexing and single unique numeric identifier for database
29 position ranging from 1 to I<size>.
30
31 Simply, something that is indexed by unmber from 1 .. I<size>.
32
33 Examples of such databases are CDS/ISIS files, MARC files, lines in
34 text file, and so on.
35
36 Specific file formats are implemented using low-level interface modules,
37 located in C<WebPAC::Input::*> namespace which export C<open_db>,
38 C<fetch_rec> and optional C<init> functions.
39
40 Perhaps a little code snippet.
41
42     use WebPAC::Input;
43
44     my $db = WebPAC::Input->new(
45         module => 'WebPAC::Input::ISIS',
46                 config => $config,
47                 lookup => $lookup_obj,
48                 low_mem => 1,
49     );
50
51     $db->open('/path/to/database');
52         print "database size: ",$db->size,"\n";
53         while (my $rec = $db->fetch) {
54                 # do something with $rec
55         }
56
57
58
59 =head1 FUNCTIONS
60
61 =head2 new
62
63 Create new input database object.
64
65   my $db = new WebPAC::Input(
66         module => 'WebPAC::Input::MARC',
67         code_page => 'ISO-8859-2',
68         low_mem => 1,
69         recode => 'char pairs',
70         no_progress_bar => 1,
71   );
72
73 C<module> is low-level file format module. See L<WebPAC::Input::Isis> and
74 L<WebPAC::Input::MARC>.
75
76 Optional parametar C<code_page> specify application code page (which will be
77 used internally). This should probably be your terminal encoding, and by
78 default, it C<ISO-8859-2>.
79
80 Default is not to use C<low_mem> options (see L<MEMORY USAGE> below).
81
82 C<recode> is optional string constisting of character or words pairs that
83 should be replaced in input stream.
84
85 C<no_progress_bar> disables progress bar output on C<STDOUT>
86
87 This function will also call low-level C<init> if it exists with same
88 parametars.
89
90 =cut
91
92 sub new {
93         my $class = shift;
94         my $self = {@_};
95         bless($self, $class);
96
97         my $log = $self->_get_logger;
98
99         $log->logconfess("specify low-level file format module") unless ($self->{module});
100         my $module = $self->{module};
101         $module =~ s#::#/#g;
102         $module .= '.pm';
103         $log->debug("require low-level module $self->{module} from $module");
104
105         require $module;
106         #eval $self->{module} .'->import';
107
108         # check if required subclasses are implemented
109         foreach my $subclass (qw/open_db fetch_rec init/) {
110                 my $n = $self->{module} . '::' . $subclass;
111                 if (! defined &{ $n }) {
112                         my $missing = "missing $subclass in $self->{module}";
113                         $self->{$subclass} = sub { $log->logwarn($missing) };
114                 } else {
115                         $self->{$subclass} = \&{ $n };
116                 }
117         }
118
119         if ($self->{init}) {
120                 $log->debug("calling init");
121                 $self->{init}->($self, @_);
122         }
123
124         $self->{'code_page'} ||= 'ISO-8859-2';
125
126         # running with low_mem flag? well, use DBM::Deep then.
127         if ($self->{'low_mem'}) {
128                 $log->info("running with low_mem which impacts performance (<32 Mb memory usage)");
129
130                 my $db_file = "data.db";
131
132                 if (-e $db_file) {
133                         unlink $db_file or $log->logdie("can't remove '$db_file' from last run");
134                         $log->debug("removed '$db_file' from last run");
135                 }
136
137                 require DBM::Deep;
138
139                 my $db = new DBM::Deep $db_file;
140
141                 $log->logdie("DBM::Deep error: $!") unless ($db);
142
143                 if ($db->error()) {
144                         $log->logdie("can't open '$db_file' under low_mem: ",$db->error());
145                 } else {
146                         $log->debug("using file '$db_file' for DBM::Deep");
147                 }
148
149                 $self->{'db'} = $db;
150         }
151
152         $self ? return $self : return undef;
153 }
154
155 =head2 open
156
157 This function will read whole database in memory and produce lookups.
158
159  $input->open(
160         path => '/path/to/database/file',
161         code_page => '852',
162         limit => 500,
163         offset => 6000,
164         lookup => $lookup_obj,
165         stats => 1,
166  );
167
168 By default, C<code_page> is assumed to be C<852>.
169
170 C<offset> is optional parametar to position at some offset before reading from database.
171
172 C<limit> is optional parametar to read just C<limit> records from database
173
174 C<stats> create optional report about usage of fields and subfields
175
176 Returns size of database, regardless of C<offset> and C<limit>
177 parametars, see also C<size>.
178
179 =cut
180
181 sub open {
182         my $self = shift;
183         my $arg = {@_};
184
185         my $log = $self->_get_logger();
186
187         $log->logcroak("need path") if (! $arg->{'path'});
188         my $code_page = $arg->{'code_page'} || '852';
189
190         # store data in object
191         $self->{'input_code_page'} = $code_page;
192         foreach my $v (qw/path offset limit/) {
193                 $self->{$v} = $arg->{$v} if ($arg->{$v});
194         }
195
196         # create Text::Iconv object
197         $self->{iconv} = Text::Iconv->new($code_page,$self->{'code_page'});
198
199         my $filter_ref;
200
201         if ($self->{recode}) {
202                 my @r = split(/\s/, $self->{recode});
203                 if ($#r % 2 != 1) {
204                         $log->logwarn("recode needs even number of elements (some number of valid pairs)");
205                 } else {
206                         my $recode;
207                         while (@r) {
208                                 my $from = shift @r;
209                                 my $to = shift @r;
210                                 $recode->{$from} = $to;
211                         }
212
213                         my $regex = join '|' => keys %{ $recode };
214
215                         $log->debug("using recode regex: $regex");
216                         
217                         $filter_ref = sub {
218                                 my $t = shift;
219                                 $t =~ s/($regex)/$recode->{$1}/g;
220                                 return $t;
221                         };
222
223                 }
224
225         }
226
227         my ($db, $size) = $self->{open_db}->( $self, 
228                 path => $arg->{path},
229                 filter => $filter_ref,
230                 %{ $arg },
231         );
232
233         unless (defined($db)) {
234                 $log->logwarn("can't open database $arg->{path}, skipping...");
235                 return;
236         }
237
238         unless ($size) {
239                 $log->logwarn("no records in database $arg->{path}, skipping...");
240                 return;
241         }
242
243         my $from_rec = 1;
244         my $to_rec = $size;
245
246         if (my $s = $self->{offset}) {
247                 $log->debug("skipping to MFN $s");
248                 $from_rec = $s;
249         } else {
250                 $self->{offset} = $from_rec;
251         }
252
253         if ($self->{limit}) {
254                 $log->debug("limiting to ",$self->{limit}," records");
255                 $to_rec = $from_rec + $self->{limit} - 1;
256                 $to_rec = $size if ($to_rec > $size);
257         }
258
259         # store size for later
260         $self->{size} = ($to_rec - $from_rec) ? ($to_rec - $from_rec + 1) : 0;
261
262         $log->info("processing $self->{size}/$size records [$from_rec-$to_rec] convert $code_page -> $self->{code_page}", $self->{stats} ? ' [stats]' : '');
263
264         # read database
265         for (my $pos = $from_rec; $pos <= $to_rec; $pos++) {
266
267                 $log->debug("position: $pos\n");
268
269                 my $rec = $self->{fetch_rec}->($self, $db, $pos );
270
271                 $log->debug(sub { Dumper($rec) });
272
273                 if (! $rec) {
274                         $log->warn("record $pos empty? skipping...");
275                         next;
276                 }
277
278                 # store
279                 if ($self->{low_mem}) {
280                         $self->{db}->put($pos, $rec);
281                 } else {
282                         $self->{data}->{$pos} = $rec;
283                 }
284
285                 # create lookup
286                 $self->{'lookup'}->add( $rec ) if ($rec && $self->{'lookup'});
287
288                 # update counters for statistics
289                 if ($self->{stats}) {
290                         map {
291                                 my $fld = $_;
292                                 $self->{_stats}->{fld}->{ $fld }++;
293                                 if (ref($rec->{ $fld }) eq 'ARRAY') {
294                                         map {
295                                                 if (ref($_) eq 'HASH') {
296                                                         map {
297                                                                 $self->{_stats}->{sf}->{ $fld }->{ $_ }++;
298                                                         } keys %{ $_ };
299                                                 } else {
300                                                         $self->{_stats}->{repeatable}->{ $fld }++;
301                                                 }
302                                         } @{ $rec->{$fld} };
303                                 }
304                         } keys %{ $rec };
305                 }
306
307                 $self->progress_bar($pos,$to_rec) unless ($self->{no_progress_bar});
308
309         }
310
311         $self->{pos} = -1;
312         $self->{last_pcnt} = 0;
313
314         # store max mfn and return it.
315         $self->{max_pos} = $to_rec;
316         $log->debug("max_pos: $to_rec");
317
318         return $size;
319 }
320
321 =head2 fetch
322
323 Fetch next record from database. It will also displays progress bar.
324
325  my $rec = $isis->fetch;
326
327 Record from this function should probably go to C<data_structure> for
328 normalisation.
329
330 =cut
331
332 sub fetch {
333         my $self = shift;
334
335         my $log = $self->_get_logger();
336
337         $log->logconfess("it seems that you didn't load database!") unless ($self->{pos});
338
339         if ($self->{pos} == -1) {
340                 $self->{pos} = $self->{offset};
341         } else {
342                 $self->{pos}++;
343         }
344
345         my $mfn = $self->{pos};
346
347         if ($mfn > $self->{max_pos}) {
348                 $self->{pos} = $self->{max_pos};
349                 $log->debug("at EOF");
350                 return;
351         }
352
353         $self->progress_bar($mfn,$self->{max_pos}) unless ($self->{no_progress_bar});
354
355         my $rec;
356
357         if ($self->{low_mem}) {
358                 $rec = $self->{db}->get($mfn);
359         } else {
360                 $rec = $self->{data}->{$mfn};
361         }
362
363         $rec ||= 0E0;
364 }
365
366 =head2 pos
367
368 Returns current record number (MFN).
369
370  print $isis->pos;
371
372 First record in database has position 1.
373
374 =cut
375
376 sub pos {
377         my $self = shift;
378         return $self->{pos};
379 }
380
381
382 =head2 size
383
384 Returns number of records in database
385
386  print $isis->size;
387
388 Result from this function can be used to loop through all records
389
390  foreach my $mfn ( 1 ... $isis->size ) { ... }
391
392 because it takes into account C<offset> and C<limit>.
393
394 =cut
395
396 sub size {
397         my $self = shift;
398         return $self->{size};
399 }
400
401 =head2 seek
402
403 Seek to specified MFN in file.
404
405  $isis->seek(42);
406
407 First record in database has position 1.
408
409 =cut
410
411 sub seek {
412         my $self = shift;
413         my $pos = shift || return;
414
415         my $log = $self->_get_logger();
416
417         if ($pos < 1) {
418                 $log->warn("seek before first record");
419                 $pos = 1;
420         } elsif ($pos > $self->{max_pos}) {
421                 $log->warn("seek beyond last record");
422                 $pos = $self->{max_pos};
423         }
424
425         return $self->{pos} = (($pos - 1) || -1);
426 }
427
428 =head2 stats
429
430 Dump statistics about field and subfield usage
431
432   print $input->stats;
433
434 =cut
435
436 sub stats {
437         my $self = shift;
438
439         my $log = $self->_get_logger();
440
441         my $s = $self->{_stats};
442         if (! $s) {
443                 $log->warn("called stats, but there is no statistics collected");
444                 return;
445         }
446
447         my $max_fld = 0;
448
449         my $out = join("\n",
450                 map {
451                         my $f = $_ || die "no field";
452                         my $v = $s->{fld}->{$f} || die "no s->{fld}->{$f}";
453                         $max_fld = $v if ($v > $max_fld);
454
455                         my $o = sprintf("%4s %d ~", $f, $v);
456
457                         if (defined($s->{sf}->{$f})) {
458                                 map {
459                                         $o .= sprintf(" %s:%d", $_, $s->{sf}->{$f}->{$_});
460                                 } sort keys %{ $s->{sf}->{$f} };
461                         }
462
463                         if (my $v_r = $s->{repeatable}->{$f}) {
464                                 $o .= " ($v_r)" if ($v_r != $v);
465                         }
466
467                         $o;
468                 } sort { $a cmp $b } keys %{ $s->{fld} }
469         );
470
471         $log->debug( sub { Dumper($s) } );
472
473         return $out;
474 }
475
476 =head1 MEMORY USAGE
477
478 C<low_mem> options is double-edged sword. If enabled, WebPAC
479 will run on memory constraint machines (which doesn't have enough
480 physical RAM to create memory structure for whole source database).
481
482 If your machine has 512Mb or more of RAM and database is around 10000 records,
483 memory shouldn't be an issue. If you don't have enough physical RAM, you
484 might consider using virtual memory (if your operating system is handling it
485 well, like on FreeBSD or Linux) instead of dropping to L<DBM::Deep> to handle
486 parsed structure of ISIS database (this is what C<low_mem> option does).
487
488 Hitting swap at end of reading source database is probably o.k. However,
489 hitting swap before 90% will dramatically decrease performance and you will
490 be better off with C<low_mem> and using rest of availble memory for
491 operating system disk cache (Linux is particuallary good about this).
492 However, every access to database record will require disk access, so
493 generation phase will be slower 10-100 times.
494
495 Parsed structures are essential - you just have option to trade RAM memory
496 (which is fast) for disk space (which is slow). Be sure to have planty of
497 disk space if you are using C<low_mem> and thus L<DBM::Deep>.
498
499 However, when WebPAC is running on desktop machines (or laptops :-), it's
500 highly undesireable for system to start swapping. Using C<low_mem> option can
501 reduce WecPAC memory usage to around 64Mb for same database with lookup
502 fields and sorted indexes which stay in RAM. Performance will suffer, but
503 memory usage will really be minimal. It might be also more confortable to
504 run WebPAC reniced on those machines.
505
506
507 =head1 AUTHOR
508
509 Dobrica Pavlinusic, C<< <dpavlin@rot13.org> >>
510
511 =head1 COPYRIGHT & LICENSE
512
513 Copyright 2005 Dobrica Pavlinusic, All Rights Reserved.
514
515 This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
516 under the same terms as Perl itself.
517
518 =cut
519
520 1; # End of WebPAC::Input