r1045@llin: dpavlin | 2006-09-29 21:38:42 +0200
[webpac2] / lib / WebPAC / Input.pm
index 79c859b..7ac1a7c 100644 (file)
@@ -3,37 +3,56 @@ package WebPAC::Input;
 use warnings;
 use strict;
 
+use blib;
+
+use WebPAC::Common;
+use base qw/WebPAC::Common/;
+use Data::Dumper;
+use Encode qw/from_to/;
+
 =head1 NAME
 
-WebPAC::Input - core module for input file format
+WebPAC::Input - read different file formats into WebPAC
 
 =head1 VERSION
 
-Version 0.01
+Version 0.13
 
 =cut
 
-our $VERSION = '0.01';
+our $VERSION = '0.13';
 
 =head1 SYNOPSIS
 
-This module will load particular loader module and execute it's functions.
+This module implements input as database which have fixed and known
+I<size> while indexing and single unique numeric identifier for database
+position ranging from 1 to I<size>.
+
+Simply, something that is indexed by unmber from 1 .. I<size>.
+
+Examples of such databases are CDS/ISIS files, MARC files, lines in
+text file, and so on.
+
+Specific file formats are implemented using low-level interface modules,
+located in C<WebPAC::Input::*> namespace which export C<open_db>,
+C<fetch_rec> and optional C<init> functions.
 
 Perhaps a little code snippet.
 
-    use WebPAC::Input;
+       use WebPAC::Input;
+
+       my $db = WebPAC::Input->new(
+               module => 'WebPAC::Input::ISIS',
+               low_mem => 1,
+       );
+
+       $db->open( path => '/path/to/database' );
+       print "database size: ",$db->size,"\n";
+       while (my $rec = $db->fetch) {
+               # do something with $rec
+       }
 
-    my $db = WebPAC::Input->new(
-       format => 'NULL',
-       config => $config,
-    );
 
-    $db->open('/path/to/database');
-    print "database size: ",$db->size,"\n";
-    while (my $row = $db->fetch) {
-       ...
-    }
-    $db->close;
 
 =head1 FUNCTIONS
 
@@ -41,35 +60,607 @@ Perhaps a little code snippet.
 
 Create new input database object.
 
-  my $db = new WebPAC::Input( format => 'NULL' );
+  my $db = new WebPAC::Input(
+       module => 'WebPAC::Input::MARC',
+       encoding => 'ISO-8859-2',
+       low_mem => 1,
+       recode => 'char pairs',
+       no_progress_bar => 1,
+  );
+
+C<module> is low-level file format module. See L<WebPAC::Input::ISIS> and
+L<WebPAC::Input::MARC>.
+
+Optional parametar C<encoding> specify application code page (which will be
+used internally). This should probably be your terminal encoding, and by
+default, it C<ISO-8859-2>.
 
-This function will load needed wrapper module and
+Default is not to use C<low_mem> options (see L<MEMORY USAGE> below).
+
+C<recode> is optional string constisting of character or words pairs that
+should be replaced in input stream.
+
+C<no_progress_bar> disables progress bar output on C<STDOUT>
+
+This function will also call low-level C<init> if it exists with same
+parametars.
 
 =cut
 
 sub new {
-        my $class = shift;
-        my $self = {@_};
+       my $class = shift;
+       my $self = {@_};
        bless($self, $class);
 
+       my $log = $self->_get_logger;
+
+       $log->logconfess("code_page argument is not suppored any more. change it to encoding") if ($self->{lookup});
+       $log->logconfess("lookup argument is not suppored any more. rewrite call to lookup_ref") if ($self->{lookup});
+
+       $log->logconfess("specify low-level file format module") unless ($self->{module});
+       my $module_path = $self->{module};
+       $module_path =~ s#::#/#g;
+       $module_path .= '.pm';
+       $log->debug("require low-level module $self->{module} from $module_path");
+
+       require $module_path;
+
+       # check if required subclasses are implemented
+       foreach my $subclass (qw/open_db fetch_rec init dump_rec/) {
+               # FIXME
+       }
+
+       $self->{'encoding'} ||= 'ISO-8859-2';
+
+       # running with low_mem flag? well, use DBM::Deep then.
+       if ($self->{'low_mem'}) {
+               $log->info("running with low_mem which impacts performance (<32 Mb memory usage)");
+
+               my $db_file = "data.db";
+
+               if (-e $db_file) {
+                       unlink $db_file or $log->logdie("can't remove '$db_file' from last run");
+                       $log->debug("removed '$db_file' from last run");
+               }
+
+               require DBM::Deep;
+
+               my $db = new DBM::Deep $db_file;
+
+               $log->logdie("DBM::Deep error: $!") unless ($db);
+
+               if ($db->error()) {
+                       $log->logdie("can't open '$db_file' under low_mem: ",$db->error());
+               } else {
+                       $log->debug("using file '$db_file' for DBM::Deep");
+               }
+
+               $self->{'db'} = $db;
+       }
+
        $self ? return $self : return undef;
 }
 
 =head2 open
 
+This function will read whole database in memory and produce lookups.
+
+ $input->open(
+       path => '/path/to/database/file',
+       code_page => 'cp852',
+       limit => 500,
+       offset => 6000,
+       stats => 1,
+       lookup_coderef => sub {
+               my $rec = shift;
+               # store lookups
+       },
+       modify_records => {
+               900 => { '^a' => { ' : ' => '^b' } },
+               901 => { '*' => { '^b' => ' ; ' } },
+       },
+       modify_file => 'conf/modify/mapping.map',
+ );
+
+By default, C<code_page> is assumed to be C<cp852>.
+
+C<offset> is optional parametar to position at some offset before reading from database.
+
+C<limit> is optional parametar to read just C<limit> records from database
+
+C<stats> create optional report about usage of fields and subfields
+
+C<lookup_coderef> is closure to called to save data into lookups
+
+C<modify_records> specify mapping from subfields to delimiters or from
+delimiters to subfields, as well as oprations on fields (if subfield is
+defined as C<*>.
+
+C<modify_file> is alternative for C<modify_records> above which preserves order and offers
+(hopefully) simplier sintax than YAML or perl (see L</modify_file_regex>). This option
+overrides C<modify_records> if both exists for same input.
+
+Returns size of database, regardless of C<offset> and C<limit>
+parametars, see also C<size>.
+
 =cut
 
 sub open {
+       my $self = shift;
+       my $arg = {@_};
+
+       my $log = $self->_get_logger();
+
+       $log->logconfess("lookup argument is not suppored any more. rewrite call to lookup_coderef") if ($arg->{lookup});
+       $log->logconfess("lookup_coderef must be CODE, not ",ref($arg->{lookup_coderef}))
+               if ($arg->{lookup_coderef} && ref($arg->{lookup_coderef}) ne 'CODE');
+
+       $log->debug( $arg->{lookup_coderef} ? '' : 'not ', "using lookup_coderef");
+
+       $log->logcroak("need path") if (! $arg->{'path'});
+       my $code_page = $arg->{'code_page'} || 'cp852';
+
+       # store data in object
+       $self->{'input_code_page'} = $code_page;
+       foreach my $v (qw/path offset limit/) {
+               $self->{$v} = $arg->{$v} if ($arg->{$v});
+       }
+
+       my $filter_ref;
+       my $recode_regex;
+       my $recode_map;
+
+       if ($self->{recode}) {
+               my @r = split(/\s/, $self->{recode});
+               if ($#r % 2 != 1) {
+                       $log->logwarn("recode needs even number of elements (some number of valid pairs)");
+               } else {
+                       while (@r) {
+                               my $from = shift @r;
+                               my $to = shift @r;
+                               $recode_map->{$from} = $to;
+                       }
+
+                       $recode_regex = join '|' => keys %{ $recode_map };
+
+                       $log->debug("using recode regex: $recode_regex");
+               }
+
+       }
+
+       my $rec_regex;
+       if (my $p = $arg->{modify_file}) {
+               $log->debug("using modify_file $p");
+               $rec_regex = $self->modify_file_regexps( $p );
+       } elsif (my $h = $arg->{modify_records}) {
+               $log->debug("using modify_records ", Dumper( $h ));
+               $rec_regex = $self->modify_record_regexps(%{ $h });
+       }
+       $log->debug("rec_regex: ", Dumper($rec_regex)) if ($rec_regex);
+
+       my $class = $self->{module} || $log->logconfess("can't get low-level module name!");
+
+       my $ll_db = $class->new(
+               path => $arg->{path},
+#              filter => sub {
+#                      my ($l,$f_nr) = @_;
+#                      return unless defined($l);
+#                      from_to($l, $code_page, $self->{'encoding'});
+#                      $l =~ s/($recode_regex)/$recode_map->{$1}/g if ($recode_regex && $recode_map);
+#                      return $l;
+#              },
+               %{ $arg },
+       );
+
+       unless (defined($ll_db)) {
+               $log->logwarn("can't open database $arg->{path}, skipping...");
+               return;
+       }
+
+       my $size = $ll_db->size;
+
+       unless ($size) {
+               $log->logwarn("no records in database $arg->{path}, skipping...");
+               return;
+       }
+
+       my $from_rec = 1;
+       my $to_rec = $size;
+
+       if (my $s = $self->{offset}) {
+               $log->debug("skipping to MFN $s");
+               $from_rec = $s;
+       } else {
+               $self->{offset} = $from_rec;
+       }
+
+       if ($self->{limit}) {
+               $log->debug("limiting to ",$self->{limit}," records");
+               $to_rec = $from_rec + $self->{limit} - 1;
+               $to_rec = $size if ($to_rec > $size);
+       }
+
+       # store size for later
+       $self->{size} = ($to_rec - $from_rec) ? ($to_rec - $from_rec + 1) : 0;
+
+       $log->info("processing $self->{size}/$size records [$from_rec-$to_rec] convert $code_page -> $self->{encoding}", $self->{stats} ? ' [stats]' : '');
+
+       # read database
+       for (my $pos = $from_rec; $pos <= $to_rec; $pos++) {
+
+               $log->debug("position: $pos\n");
+
+               my $rec = $ll_db->fetch_rec($pos, sub {
+                               my ($l,$f_nr) = @_;
+#                              return unless defined($l);
+#                              return $l unless ($rec_regex && $f_nr);
+
+                               $log->debug("-=> $f_nr ## $l");
+
+                               # codepage conversion and recode_regex
+                               from_to($l, $code_page, $self->{'encoding'});
+                               $l =~ s/($recode_regex)/$recode_map->{$1}/g if ($recode_regex && $recode_map);
+
+                               # apply regexps
+                               if ($rec_regex && defined($rec_regex->{$f_nr})) {
+                                       $log->logconfess("regexps->{$f_nr} must be ARRAY") if (ref($rec_regex->{$f_nr}) ne 'ARRAY');
+                                       my $c = 0;
+                                       foreach my $r (@{ $rec_regex->{$f_nr} }) {
+                                               my $old_l = $l;
+                                               eval '$l =~ ' . $r;
+                                               if ($old_l ne $l) {
+                                                       $log->debug("REGEX on $f_nr eval \$l =~ $r\n## old l: [$old_l]\n## new l: [$l]");
+                                               }
+                                               $log->error("error applying regex: $r") if ($@);
+                                       }
+                               }
+
+                               $log->debug("<=- $f_nr ## $l");
+                               return $l;
+               });
+
+               $log->debug(sub { Dumper($rec) });
+
+               if (! $rec) {
+                       $log->warn("record $pos empty? skipping...");
+                       next;
+               }
+
+               # store
+               if ($self->{low_mem}) {
+                       $self->{db}->put($pos, $rec);
+               } else {
+                       $self->{data}->{$pos} = $rec;
+               }
+
+               # create lookup
+               $arg->{'lookup_coderef'}->( $rec ) if ($rec && $arg->{'lookup_coderef'});
+
+               # update counters for statistics
+               if ($self->{stats}) {
+
+                       # fetch clean record with regexpes applied for statistics
+                       my $rec = $ll_db->fetch_rec($pos);
+
+                       foreach my $fld (keys %{ $rec }) {
+                               $self->{_stats}->{fld}->{ $fld }++;
+
+                               $log->logdie("invalid record fild $fld, not ARRAY")
+                                       unless (ref($rec->{ $fld }) eq 'ARRAY');
+       
+                               foreach my $row (@{ $rec->{$fld} }) {
+
+                                       if (ref($row) eq 'HASH') {
+
+                                               foreach my $sf (keys %{ $row }) {
+                                                       next if ($sf eq 'subfields');
+                                                       $self->{_stats}->{sf}->{ $fld }->{ $sf }->{count}++;
+                                                       $self->{_stats}->{sf}->{ $fld }->{ $sf }->{repeatable}++
+                                                                       if (ref($row->{$sf}) eq 'ARRAY');
+                                               }
+
+                                       } else {
+                                               $self->{_stats}->{repeatable}->{ $fld }++;
+                                       }
+                               }
+                       }
+               }
+
+               $self->progress_bar($pos,$to_rec) unless ($self->{no_progress_bar});
+
+       }
+
+       $self->{pos} = -1;
+       $self->{last_pcnt} = 0;
+
+       # store max mfn and return it.
+       $self->{max_pos} = $to_rec;
+       $log->debug("max_pos: $to_rec");
+
+       return $size;
 }
 
-=head2 function2
+=head2 fetch
+
+Fetch next record from database. It will also displays progress bar.
+
+ my $rec = $isis->fetch;
+
+Record from this function should probably go to C<data_structure> for
+normalisation.
 
 =cut
 
-sub function2 {
+sub fetch {
+       my $self = shift;
+
+       my $log = $self->_get_logger();
+
+       $log->logconfess("it seems that you didn't load database!") unless ($self->{pos});
+
+       if ($self->{pos} == -1) {
+               $self->{pos} = $self->{offset};
+       } else {
+               $self->{pos}++;
+       }
+
+       my $mfn = $self->{pos};
+
+       if ($mfn > $self->{max_pos}) {
+               $self->{pos} = $self->{max_pos};
+               $log->debug("at EOF");
+               return;
+       }
+
+       $self->progress_bar($mfn,$self->{max_pos}) unless ($self->{no_progress_bar});
+
+       my $rec;
+
+       if ($self->{low_mem}) {
+               $rec = $self->{db}->get($mfn);
+       } else {
+               $rec = $self->{data}->{$mfn};
+       }
+
+       $rec ||= 0E0;
 }
 
+=head2 pos
+
+Returns current record number (MFN).
+
+ print $isis->pos;
+
+First record in database has position 1.
+
+=cut
+
+sub pos {
+       my $self = shift;
+       return $self->{pos};
+}
+
+
+=head2 size
+
+Returns number of records in database
+
+ print $isis->size;
+
+Result from this function can be used to loop through all records
+
+ foreach my $mfn ( 1 ... $isis->size ) { ... }
+
+because it takes into account C<offset> and C<limit>.
+
+=cut
+
+sub size {
+       my $self = shift;
+       return $self->{size};
+}
+
+=head2 seek
+
+Seek to specified MFN in file.
 
+ $isis->seek(42);
+
+First record in database has position 1.
+
+=cut
+
+sub seek {
+       my $self = shift;
+       my $pos = shift || return;
+
+       my $log = $self->_get_logger();
+
+       if ($pos < 1) {
+               $log->warn("seek before first record");
+               $pos = 1;
+       } elsif ($pos > $self->{max_pos}) {
+               $log->warn("seek beyond last record");
+               $pos = $self->{max_pos};
+       }
+
+       return $self->{pos} = (($pos - 1) || -1);
+}
+
+=head2 stats
+
+Dump statistics about field and subfield usage
+
+  print $input->stats;
+
+=cut
+
+sub stats {
+       my $self = shift;
+
+       my $log = $self->_get_logger();
+
+       my $s = $self->{_stats};
+       if (! $s) {
+               $log->warn("called stats, but there is no statistics collected");
+               return;
+       }
+
+       my $max_fld = 0;
+
+       my $out = join("\n",
+               map {
+                       my $f = $_ || die "no field";
+                       my $v = $s->{fld}->{$f} || die "no s->{fld}->{$f}";
+                       $max_fld = $v if ($v > $max_fld);
+
+                       my $o = sprintf("%4s %d ~", $f, $v);
+
+                       if (defined($s->{sf}->{$f})) {
+                               map {
+                                       $o .= sprintf(" %s:%d%s", $_, 
+                                               $s->{sf}->{$f}->{$_}->{count},
+                                               $s->{sf}->{$f}->{$_}->{repeatable} ? '*' : '',
+                                       );
+                               } sort keys %{ $s->{sf}->{$f} };
+                       }
+
+                       if (my $v_r = $s->{repeatable}->{$f}) {
+                               $o .= " ($v_r)" if ($v_r != $v);
+                       }
+
+                       $o;
+               } sort { $a cmp $b } keys %{ $s->{fld} }
+       );
+
+       $log->debug( sub { Dumper($s) } );
+
+       return $out;
+}
+
+=head2 dump
+
+Display humanly readable dump of record
+
+=cut
+
+sub dump {
+       my $self = shift;
+
+       return $self->{dump_rec}->($self, $self->{pos});
+
+}
+
+=head2 modify_record_regexps
+
+Generate hash with regexpes to be applied using l<filter>.
+
+  my $regexpes = $input->modify_record_regexps(
+               900 => { '^a' => { ' : ' => '^b' } },
+               901 => { '*' => { '^b' => ' ; ' } },
+  );
+
+=cut
+
+sub _get_regex {
+       my ($sf,$from,$to) = @_;
+       if ($sf =~ /^\^/) {
+               return
+                       's/\Q'. $sf .'\E([^\^]*?)\Q'. $from .'\E([^\^]*?)/'. $sf .'$1'. $to .'$2/';
+       } else {
+               return
+                       's/\Q'. $from .'\E/'. $to .'/g';
+       }
+}
+
+sub modify_record_regexps {
+       my $self = shift;
+       my $modify_record = {@_};
+
+       my $regexpes;
+
+       my $log = $self->_get_logger();
+
+       foreach my $f (keys %$modify_record) {
+               $log->debug("field: $f");
+
+               foreach my $sf (keys %{ $modify_record->{$f} }) {
+                       $log->debug("subfield: $sf");
+
+                       foreach my $from (keys %{ $modify_record->{$f}->{$sf} }) {
+                               my $to = $modify_record->{$f}->{$sf}->{$from};
+                               #die "no field?" unless defined($to);
+                               $log->debug("transform: |$from| -> |$to|");
+
+                               my $regex = _get_regex($sf,$from,$to);
+                               push @{ $regexpes->{$f} }, $regex;
+                               $log->debug("regex: $regex");
+                       }
+               }
+       }
+
+       return $regexpes;
+}
+
+=head2 modify_file_regexps
+
+Generate hash with regexpes to be applied using l<filter> from
+pseudo hash/yaml format for regex mappings.
+
+It should be obvious:
+
+       200
+         '^a'
+           ' : ' => '^e'
+           ' = ' => '^d'
+
+In field I<200> find C<'^a'> and then C<' : '>, and replace it with C<'^e'>.
+In field I<200> find C<'^a'> and then C<' = '>, and replace it with C<'^d'>.
+
+  my $regexpes = $input->modify_file_regexps( 'conf/modify/common.pl' );
+
+On undef path it will just return.
+
+=cut
+
+sub modify_file_regexps {
+       my $self = shift;
+
+       my $modify_path = shift || return;
+
+       my $log = $self->_get_logger();
+
+       my $regexpes;
+
+       CORE::open(my $fh, $modify_path) || $log->logdie("can't open modify file $modify_path: $!");
+
+       my ($f,$sf);
+
+       while(<$fh>) {
+               chomp;
+               next if (/^#/ || /^\s*$/);
+
+               if (/^\s*(\d+)\s*$/) {
+                       $f = $1;
+                       $log->debug("field: $f");
+                       next;
+               } elsif (/^\s*'([^']*)'\s*$/) {
+                       $sf = $1;
+                       $log->die("can't define subfiled before field in: $_") unless ($f);
+                       $log->debug("subfield: $sf");
+               } elsif (/^\s*'([^']*)'\s*=>\s*'([^']*)'\s*$/) {
+                       my ($from,$to) = ($1, $2);
+
+                       $log->debug("transform: |$from| -> |$to|");
+
+                       my $regex = _get_regex($sf,$from,$to);
+                       push @{ $regexpes->{$f} }, $regex;
+                       $log->debug("regex: $regex");
+               }
+       }
+
+       return $regexpes;
+}
 
 =head1 MEMORY USAGE
 
@@ -108,7 +699,7 @@ Dobrica Pavlinusic, C<< <dpavlin@rot13.org> >>
 
 =head1 COPYRIGHT & LICENSE
 
-Copyright 2005 Dobrica Pavlinusic, All Rights Reserved.
+Copyright 2005-2006 Dobrica Pavlinusic, All Rights Reserved.
 
 This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
 under the same terms as Perl itself.