added header_first to WebPAC::Input::CSV
[webpac2] / run.pl
diff --git a/run.pl b/run.pl
index 036b1bb..cd940c9 100755 (executable)
--- a/run.pl
+++ b/run.pl
@@ -9,9 +9,9 @@ use lib './lib';
 use WebPAC::Common 0.02;
 use WebPAC::Parser 0.08;
 use WebPAC::Input 0.16;
-use WebPAC::Store 0.14;
+use WebPAC::Store 0.15;
 use WebPAC::Normalize 0.22;
-use WebPAC::Output::TT;
+#use WebPAC::Output::TT;
 use WebPAC::Validate 0.11;
 use WebPAC::Output::MARC;
 use WebPAC::Config;
@@ -22,8 +22,8 @@ use File::Slurp;
 use Data::Dump qw/dump/;
 use Storable qw/dclone/;
 use Pod::Usage qw/pod2usage/;
+use LWP::Simple qw//;
 
-use Proc::Queue size => 1;
 use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
 
 =head1 NAME
@@ -86,6 +86,10 @@ You can use this option as C<--no-marc-generate> to disable MARC generation.
 By default turned on if normalisation file has C<marc*> directives. You can disable lint
 messages with C<--no-marc-lint>.
 
+=item --marc-xml
+
+Creeate MARCXML file (this can be quite large)
+
 =item --marc-dump
 
 Force dump or input and marc record for debugging.
@@ -103,6 +107,10 @@ Create just links
 
 Create merged index of databases which have links
 
+=item --mirror http://www.example.com
+
+Tries to download input path files from mirror URI
+
 =back
 
 =cut
@@ -118,11 +126,13 @@ my $stats = 0;
 my $validate_path;
 my $validate_delimiters_path;
 my $marc_generate = 1;
-my $marc_lint = 1;
+my $marc_lint = 0;
 my $marc_dump = 0;
+my $marc_xml = 0;
 my $parallel = 0;
 my $only_links = 0;
 my $merge = 0;
+my $mirror;
 my $help;
 
 my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
@@ -133,7 +143,7 @@ GetOptions(
        "clean" => \$clean,
        "one=s" => \$only_filter,
        "only=s" => \$only_filter,
-       "config" => \$config_path,
+       "config=s" => \$config_path,
        "debug+" => \$debug,
        "stats" => \$stats,
        "validate=s" => \$validate_path,
@@ -141,9 +151,11 @@ GetOptions(
        "marc-generate!" => \$marc_generate,
        "marc-lint!" => \$marc_lint,
        "marc-dump!" => \$marc_dump,
+       "marcxml!" => \$marc_xml,
        "parallel=i" => \$parallel,
        "only-links!" => \$only_links,
        "merge" => \$merge,
+       "mirror=s" => \$mirror,
        "help" => \$help,
 );
 
@@ -153,6 +165,8 @@ pod2usage(-verbose => 2) if ($help);
 
 my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
 
+WebPAC::Normalize::_debug( $debug - 1 ) if $debug > 1;
+
 #print "config = ",dump($config) if ($debug);
 
 die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
@@ -191,7 +205,13 @@ if ($stats) {
 
 # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
 
-my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
+my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if $only_filter;
+
+my $parser = new WebPAC::Parser(
+       config => $config,
+       only_database => $only_database,
+       only_input => $only_input,
+);
 
 my $total_rows = 0;
 my $start_t = time();
@@ -199,6 +219,8 @@ my $start_t = time();
 my @links;
 
 if ($parallel) {
+       eval 'use Proc::Queue size => 1;';
+       die $@ if $@;
        $log->info("Using $parallel processes for speedup");
        Proc::Queue::size($parallel);
 }
@@ -215,7 +237,6 @@ sub create_ds_config {
 foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
        my $db_config = $config->databases->{$database};
 
-       my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
        next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
 
        if ($parallel) {
@@ -255,10 +276,7 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
 
                } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
 
-                       # open KinoSearch
-                       require WebPAC::Output::KinoSearch;
-                       $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
-                       $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
+                       die "no longer supported";
 
                } else {
                        $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
@@ -298,52 +316,97 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
        #
        # now WebPAC::Store
        #
-       my $abs_path = abs_path($0);
-       $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
+       my $store = new WebPAC::Store({
+               debug => $debug,
+       });
 
-       my $db_path = $config->webpac('db_path');
 
-       if ($clean) {
-               $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
-               rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
-       } else {
-               $log->info("working on database '$database' in $db_path");
-       }
+       #
+       # prepare output
+       #
+       my @outputs = force_array( $db_config->{output}, sub {
+               $log->error("Database $database doesn't have any outputs defined. Do you want to remove it from configuration?" );
+       } );
 
-       my $store = new WebPAC::Store(
-               path => $db_path,
-               debug => $debug,
-       );
+       my @output_modules;
+
+       foreach my $output ( @outputs ) {
+
+#warn '## output = ',dump( $output );
+
+               my $module = $output->{module} || $log->logdie("need module in output section of $database");
+               $module = 'WebPAC::Output::' . $module unless $module =~ m/::/;
+       
+               $log->debug("loading output module $module");
+               eval "require $module";
+
+               # add database to arugemnts for output filter
+               $output->{database} = $database;
+               $output->{clean} = $clean;
+
+               $log->debug("calling $module->new(",dump( $output ),")");
+               my $out = new $module->new( $output );
+               if ( $out->init ) {
+                       push @output_modules, $out;
+               } else {
+                       $log->warn("SKIPPED $module");
+               }
+       }
 
 
        #
        # now, iterate through input formats
        #
 
-       my @inputs;
-       if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
-               @inputs = @{ $db_config->{input} };
-       } elsif ($db_config->{input}) {
-               push @inputs, $db_config->{input};
-       } else {
+
+       my @inputs = force_array( $db_config->{input}, sub {
                $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
-       }
+       } );
+
+       if ( -e 'out/debug' ) { # FIXME flag?
+               my $out;
+               foreach my $i ( @inputs ) {
+                       warn dump( $i );
+                       next unless defined $i->{normalize};
+                       warn dump( $i->{normalize} );
+                       foreach my $normalize ( @{ $i->{normalize} } ) {
+                               my $path = $normalize->{path};
+                               $out .= qq/\n##\n## $path\n##\n\n/;
+                               $out .= read_file( $path );
+                       }
+               }
+               my $all = "out/debug/all-normalize.pl";
+               write_file( $all, $out );
+               warn "### all normalize for this input saved to: $all";
+       };
 
        foreach my $input (@inputs) {
 
                my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
 
-               next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
+               if ( $input->{skip} ) {
+                       $log->info("skip $input_name");
+                       next;
+               }
+
+               next if defined $only_input && $input_name !~ m#$only_input#i;
 
                my $type = lc($input->{type});
 
-               die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
+               # FIXME check if input module exists
+               my $input_module = $input->{module};
 
-               my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
+               if ( ! $input_module ) {
+                       if ( grep(/$type/, $config->webpac('inputs')) ) {
+                               $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
+                       } else {
+                               $log->logdie("I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!" );
+                       }
+               }
 
                my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
 
-               $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
+               $log->info("working on $database/$input_name with $input_module on $input->{path}",
                        @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
                );
 
@@ -353,15 +416,31 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
                        delete($input->{modify_file});
                }
 
+               if ( $mirror ) {
+                       my $path = $input->{path} || die "no input path in ",dump( $input );
+
+                       my $base = $path;
+                       $base =~ s{/[^/]+$}{};
+                       mkpath $base unless -e $base;
+
+                       my $rc = LWP::Simple::mirror( "$mirror/$path", $path );
+                       if (LWP::Simple::is_error( $rc )) {
+                               die "can't mirror $mirror/$path -> $path [$rc]";
+                       } else {
+                               $log->info( "mirror ", $path, " [$rc] ", -s $path, " bytes" );
+                       }
+                       
+               }
+
                my $input_db = new WebPAC::Input(
                        module => $input_module,
-                       encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
                        limit => $limit || $input->{limit},
-                       offset => $offset,
+                       offset => $offset || $input->{offset},
                        recode => $input->{recode},
                        stats => $stats,
                        modify_records => $input->{modify_records},
                        modify_file => $input->{modify_file},
+                       input_config => $input,
                );
                $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
 
@@ -399,7 +478,7 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
 
                my $maxmfn = $input_db->open(
                        path => $input->{path},
-                       code_page => $input->{encoding},        # database encoding
+                       input_encoding => $input->{encoding},   # database encoding
                        lookup_coderef => $lookup_coderef,
                        lookup => $lookup_jar,
                        %{ $input },
@@ -440,7 +519,9 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
 
                my $report_fh;
                if ($stats || $validate) {
-                       my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
+                       my $out_report = 'out/report'; # FIXME move to config
+                       mkpath $out_report unless -e $out_report;
+                       my $path = "$out_report/${database}-${input_name}.txt";
                        open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
 
                        print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
@@ -455,14 +536,24 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
 
                my $marc;
                if ($marc_generate && $parser->have_rules( 'marc', $database, $input_name )) {
+                       
+                       my $out_marc = 'out/marc'; # FIXME move to config
+                       mkpath $out_marc unless -e $out_marc;
+
                        $marc = new WebPAC::Output::MARC(
-                               path => "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
+                               path => "$out_marc/${database}-${input_name}",
                                lint => $marc_lint,
                                dump => $marc_dump,
+                               marcxml => $marc_xml,
                        );
                }
 
-               my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
+               my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name);
+               if ( ! $rules ) {
+                       $log->logwarn("no normalize rules for $database/$input_name", $input_db->input_module->can('normalize') ? " using normalize from input module" : '');
+                       next;
+               }
+
                $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
 
                # reset position in database
@@ -498,6 +589,16 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
                }
 
 
+               # setup input name for all output filters
+               foreach my $out ( @output_modules ) {
+                       if ( $out->can('input') ) {
+                               $out->input( $input_name );
+                       } else {
+                               $log->warn("output filter ",ref($out)," doesn't support input name");
+                       }
+               }
+
+
                foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
 
                        my $row = $input_db->fetch || next;
@@ -506,12 +607,15 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
 
                        my $mfn = $row->{'000'}->[0];
 
-                       if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
+                       if (! $mfn || $mfn !~ m{^\d+$}) {
                                $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
                                $mfn = $pos;
                                push @{ $row->{'000'} }, $pos;
                        }
 
+                       foreach my $out ( @output_modules ) {
+                               $out->add_row( $mfn, $row ) if $out->can('add_row');
+                       }
 
                        if ($validate) {
                                if ( my $errors = $validate->validate_rec( $row, $input_db->dump_ascii ) ) {
@@ -522,45 +626,62 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
                                next;   # validation doesn't create any output
                        }
 
-                       my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
-                               row => $row,
-                               rules => $rules,
-                               lookup => $lookup_hash,
-                               config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
-                               marc_encoding => 'utf-8',
-                               load_row_coderef => sub {
-                                       my ($database,$input,$mfn) = @_;
-                                       return $store->load_row(
-                                               database => $database,
-                                               input => $input,
-                                               id => $mfn,
-                                       );
-                               },
-                       );
+                       my $ds;
+
+                       if ($rules) {
+
+                               $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
+                                       row => $row,
+                                       rules => $rules,
+                                       lookup => $lookup_hash,
+                                       config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
+                                       marc_encoding => 'utf-8',
+                                       load_row_coderef => sub {
+                                               my ($database,$input,$mfn) = @_;
+#warn "### load_row($database,$input,$mfn) from data_structure\n";
+                                               return $store->load_row(
+                                                       database => $database,
+                                                       input => $input,
+                                                       id => $mfn,
+                                               );
+                                       },
+                               );
 
-                       $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) }) if ($ds);
+                       } elsif ( $input_db->input_module->can('normalize') ) {
+                               $ds = $input_db->input_module->normalize( $mfn );
+                       }
 
-                       $store->save_ds(
-                               database => $database,
-                               input => $input_name,
-                               id => $mfn,
-                               ds => $ds,
-                       ) if ($ds && !$stats);
+                       if ( $ds ) {
+                               $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) });
 
-                       $indexer->add(
-                               id => "${input_name}/${mfn}",
-                               ds => $ds,
-                               type => $config->get($indexer_config)->{type},
-                       ) if ($indexer && $ds);
+                               $store->save_ds(
+                                       database => $database,
+                                       input => $input_name,
+                                       id => $mfn,
+                                       ds => $ds,
+                               ) if !$stats;
+
+                               $indexer->add(
+                                       id => "${input_name}/${mfn}",
+                                       ds => $ds,
+                                       type => $config->get($indexer_config)->{type},
+                               ) if $indexer;
+
+                               foreach my $out ( @output_modules ) {
+                                       $out->add( $mfn, $ds ) if $out->can('add');
+                               }
 
+                       } else {
+                               $log->warn("record $pos didn't produce any output after normalization rules!") unless $marc;
+                       }
                        if ($marc) {
                                my $i = 0;
 
-                               while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
+                               while (my $fields = WebPAC::Normalize::MARC::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
                                        $marc->add(
                                                id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
                                                fields => $fields,
-                                               leader => WebPAC::Normalize::_get_marc_leader(),
+                                               leader => WebPAC::Normalize::MARC::_get_marc_leader(),
                                                row => $row,
                                        );
                                        $i++;
@@ -568,6 +689,7 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
 
                                $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
                        }
+
                }
 
                if ($validate) {
@@ -596,7 +718,11 @@ foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
                close($report_fh) if ($report_fh);
        }
 
-       eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
+       $indexer->finish if $indexer && $indexer->can('finish');
+
+       foreach my $out ( @output_modules ) {
+               $out->finish if $out->can('finish');
+       }
 
        my $dt = time() - $start_t;
        $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",